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主要贡献
1，袁隆平在国内率先开展了水稻杂种优势利用的研究。他在第一篇论文《水稻雄性不育》中提出:“要想利用水稻杂种优势，首先要利用雄性不育”。他的理论和研究实践是对经典遗传学理论的挑战，否定了“自花授粉作物没有杂种优势”的传统观点，极大地丰富了作物遗传育种的理论和技术。
2.袁隆平解决了三系杂交水稻研究中的三大难题。首先提出了“野生稻与栽培稻远缘杂交”的技术方案，最终找到了培育雄性不育系的有效途径。1973实现了不育系、保持系、恢复系“三系化”。
二是育成了具有较强优势的杂交水稻“南优2号”等一批组合，并广泛应用于生产，成为世界上第一个成功利用水稻杂种优势的科学家。
三是突破了制种关口。据前人研究，水稻异交率仅为2.4%，杂交一代种子产量极低，远达不到生产要求。国际水稻研究所在1971开始研究，1973放弃，因为当时研究所没有人相信它能解决种子生产的问题。袁隆平带领的课题组成功解决了这一难题，种子产量逐渐增加，现在亩产已经达到300多公斤的高产。
3.袁隆平提出了杂交水稻育种的发展战略，即从三系到两系再到一系，程序越来越简单，效率越来越高；在杂种优势层面，从品种到亚种，再到远缘杂种优势的利用，杂种优势越来越强，推动杂交水稻一步步迈上新台阶。这一思想被国内外同行采纳，成为发展杂交水稻育种的指导思想。
4.袁隆平解决了双系统方法中的一些关键技术问题。如1989，在两系法研究遇到较大挫折时，他提出了选育实用光温敏核不育系的起始温度指标和技术策略，使两系杂交稻研究走出低谷。
后来研究提出了核心制种程序和冷水系列灌溉繁殖，使两系杂交水稻的研究最终获得成功并得以推广。1987以来，担任“863”项目特别责任专家，主持中国性合作研究。1995研究成功两系杂交稻，同熟期两系杂交稻比三系杂交稻增产5% ~ 10%。
5.袁隆平设计了高冠层、短穗层、中大穗的超高产株型模式和培育超级杂交稻的技术路线，在超级杂交稻研究方面取得了重大进展。袁隆平在1997期间开展了超级杂交稻的研究。
2000年、2004年、2012年分别实现了中国超级稻示范片第一、二、三期亩产700公斤、800公斤、900公斤的目标。2013年开始超级杂交稻百亩示范片亩产1000斤目标研究第四期，计划2020年实现目标。
同时，实施超级杂交稻“种三产四”高产工程，促进科技成果生产应用。从2007年开始，取得了很大的增产增收效果，在全国7个省市实施，其中湖南省的县(市、区)从20个增加到2012的50个，面积882万亩。
截至2012年底，累计示范推广面积2000多万亩，增产20多亿公斤，为粮食持续稳定增产做出了新贡献。
因病而死
2021 3月10，袁隆平倒在三亚杂交水稻研究基地。4月7日转到湖南长沙治疗。5月22日13: 07，袁隆平在长沙中南大学湘雅医院因多器官衰竭去世，享年91。
哀悼
2021年5月24日上午10，袁隆平同志遗体告别仪式在长沙明阳山殡仪馆明德厅举行。虽然袁隆平本人生前曾希望葬礼从简，殡仪馆不接受民众悼念，但由于他的知名度很高，长沙仍有大量民众自发到湘雅医院、明阳山殡仪馆、湖南杂交水稻研究中心吊唁。
此外，湖南省杂交水稻研究中心在海南三亚的研究基地、青岛海水稻R&D中心和西南大学袁隆平雕像也吸引了许多人前往瞻仰。此外，中国警方通报，7名网民因侮辱袁隆平被逮捕。
中共中央总书记、中国人民、中国共产党和国家许多高层人士发来慰问电或花圈表示哀悼。泰王国玛哈扎克公主？诗琳通、粮农组织总干事曲东宇、马达加斯加农牧渔业部长拉纳里·韦卢、东帝汶农业和渔业部长佩德罗？多斯雷斯等人送花或表示哀悼。
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