合肥工业大学继续教育学院函授课程太多不及格怎么办？

重新报名参加考试。根据《成人高等教育暂行条例》第三十一条的规定，合肥工业大学继续教育学院函授本科退学过多后，需要学生重新报名参加考试，并缴纳相应的学费。学生可以向学校申请复学，但需要达到学校的录取要求，并缴纳相应的费用。