重庆大学和理工大学电气工程及其自动化专业考研比较难。

1.重庆大学电气工程及其自动化专业是国家级专业，也是重庆市专业。理工大学考研电气工程及其自动化专业不是国家特色。

2.重庆大学是国家国防科技工业局设立的全国重点大学，位列全国“双一流”、“211工程”、“985工程”，考研竞争极大。何工大学是国家“双一流”建设大学，国家“211工程”建设大学。