北京大学附属医院

第二临床医学院(人民医院):西城区西直门

第三临床医学院(三院):海淀区花园北路

口腔医学院(口腔医院):海淀区龚伟村

北京肿瘤医院临床肿瘤学院:海淀区定慧寺

精神卫生研究所(第六医院):海淀区花园北路

首钢医院:石景山区金元庄路

深圳医院:深圳福田莲花路

教学医院(非附属):

第四临床医学院(北京积水潭医院，北京附属)

第五临床医学院(卫生部北京医院，隶属于国家卫生和计划生育委员会)

第九临床医学院(北京世纪坛医院，北京附属)

北京大学航天临床医学院(中国航天科技集团公司附属北京航天中心医院)

北京大学中日友好临床医学院(卫生部中日友好医院，隶属于国家卫生计生委)

北京地坛医院教学医院(北京地坛医院)

北京大学民航临床医学院(北京民航总医院)

北京大学首都儿科研究所教学医院(首都儿科研究所)

北京大学北京京煤集团总医院教学医院(北京京煤集团总医院)

北京大学北京仁和医院教学医院(北京仁和医院)

北京大学解放军306医院教学医院(解放军306医院)

北京大学解放军302医院教学医院(解放军302医院)

北京大学北京回龙观医院教学医院(北京回龙观医院)