这种情况下留学中介会退费吗？

如果合同中没有相应条款或者相关条款难以界定就不好说了。你没有申请综合类大学是因为托福没报名不能考，所以错过了截止日期。但如果真的追究，托福报名不上的责任不在中介，而在黄牛。就算这个黄牛是中介找的，中介也不直接负责。而黄牛就更不用说了，他们自己都不靠谱，而且只是口头协议，人家肯定不会管你的。

在这个事情上，最多只能说中介有间接责任。从法律角度来说，你也有责任，因为你用了一个相对无视法规的黄牛。

所以我建议你以合同为依据。第一，抓住2万元申请综合性大学，但是不管什么原因，中介只给你申请了一个社区学院，所以你只需要交1，000元；第二，虽然中介对托福报名没有直接责任，但还是有间接责任——他们找到了黄牛。而且，即使托福注册不成功，综合类院校还是可以申请的，只是在提交申请的时候不能发托福成绩，但是可以在提交申请之后，最终成绩出来之前(一般是截止日期之后1个月左右)补分。但对方并没有这么做，而是选择了申请社区学院这种更省力的解决问题的方式，这可以定义为中介工作不彻底，甚至是失职。基于以上两点，中介应该把这1万元还给你。