冯静恩大学的学校组织
法学系(法学学科、政策法学学科)、经济系(经济学学科、国际经济学学科、综合经济政策学科)、管理系(管理学学科、商学学科、会计学学科、专业商业管理学科)、文学艺术系(文学、艺术学科、文化学科、英语多元文化传播学科)、综合社会学系(综合社会学科)、建筑学系(建筑学学科)。应用化学、机械工程、电气电子工程、信息科学、社会与环境工程)、药剂学系(医学医学、创造医学)、农学系(农业与水产科学、水产、应用生命科学、食品营养、环境管理、生物科学)、生物技术系(生物工程)。电子系统信息工程学科。知识系统工程学科、基因工程学科、生物机械工程学科)、医学系(医学系)、工程系(生化工程学科、机械工程学科、智能机械工程学科、电子信息工程学科、信息系统工程学科、建筑学学科)、工业工程系(生物环境化学学科、电气与通信工程学科、建筑设计学科、信息学科、商科与商科学科)
大学(硕士、博士)
法学研究部(法学专业)、商学研究部(商科专业)、经济学研究部(经济学专业)、综合工程研究部(理科专业、材料工程专业、机械工程专业、电子工程专业、环境工程专业、东大阪制造专业)、药学研究部(药学专业)、文学艺术研究部(日本文学专业、欧美文学专业、国际专业学位课程)、农学研究部(农业生产科学、水产、应用生命化学、生物学和环境管理专业)、生物技术研究部(生物工程专业、 电子系统信息工程和机械控制工程)、医学研究部(生物物理学、病理学、社会医学、内科学和外科学专业)和系统工程研究部。
短期大学
短期本科:商业经济学(信息管理、商业秘书、企业家)、通信与教育部。
九州短期大学:保育学部生活福祉信息学部。
凤岗短期大学:(由冯静恩大学弘德学院运营):儿童学科,传播与教育系,生活信息与福利学科。
附属机构
研究所:水产研究所,附属农场和原子能研究所(成立于1960,日本第一台民间原子炉就诞生在这个研究所。目前,冯静恩大学仍是日本唯一拥有原子炉的私立大学。)、分子工程研究所、科学技术研究所、工业和法律信息研究所、人权研究所、国际人文研究所、著名民俗研究所、药学研究所、日本文化研究所、资源再生研究所、先进技术研究所、下一代模板技术研究所(原工业技术研究所)、生命科学研究所、东洋医学研究所、肿瘤免疫研究所等。
图书馆:中央图书馆、农业系图书馆、医学系图书馆、生物技术系图书馆、工程系图书馆、工业与技术系图书馆。
医学部附属机构:附属医院(大阪府山市)、堀场医院(大阪府酒井市)、奈良医院(奈良县胜举市)、关西国际机场诊所(大阪府泉佐野市关西国际机场内)、新潟诊所(大阪府大阪市)。